最高裁判所は、VAT（付加価値税）還付請求における120日ルールの適用に関する判決を下しました。この判決は、国税庁（BIR）の過去の裁定に基づき、納税者は必ずしも還付請求のために120日間の待機期間を経る必要がない場合があることを明確にしています。この判断は、VAT還付を求める企業にとって、その請求手続きに重要な影響を与える可能性があります。

120日ルール適用：BIR裁定とVAT還付請求のタイミング

本件は、Mindanao II Geothermal Partnership（以下「申立人」）が、国税庁長官（以下「被申立人」）に対し、過剰なインプットVATの還付を求めたものです。申立人は、2008年の4四半期のVAT申告を行い、未利用のインプットVATを申告しました。その後、税務署に還付請求を行いましたが、CTA（税務裁判所）に訴えられた際、120日間の待機期間を経ずに提訴したため、請求が却下されました。

120日ルールとは、NIRC（国内税法）第112条（D）項に規定されているもので、税務署長が還付または税額控除の決定を行うまでの期間を指します。従来の判例では、この期間の経過がCTAへの司法請求を行うための必須要件とされていました。しかし、本件では、BIR Ruling No. DA-489-03の存在が重要な争点となりました。

このBIR裁定は、納税者がCTAに司法救済を求めるにあたり、必ずしも120日間の待機期間を経る必要はないと解釈できる内容でした。最高裁判所は、このBIR裁定が、NIRC第246条に基づく衡平法上の禁反言の有効な主張を構成すると判断しました。つまり、国は過去の裁定に矛盾する主張をすることは許されないという原則です。

この判決により、最高裁判所は、Aichi事件とSan Roque事件における過去の判例を調和させました。その結果、2003年12月10日（BIR Ruling No. DA-489-03の発行日）から2010年10月6日（Aichi事件の公布日）までの期間は、納税者は120日間の待機期間を経ずにCTAに司法請求を行うことができました。ただし、上記の期間の前後では、120日ルールの遵守が依然として必須要件となります。

本件では、申立人はBIR Ruling No. DA-489-03が有効であった期間に、税務署への行政請求とCTAへの司法請求を行いました。したがって、申立人は120日間の期間満了を待つ必要はなく、司法請求は適時に行われたとみなされました。最高裁判所は、CTAが申立人の請求を時期尚早として却下したことは誤りであると判断しました。

しかし、最高裁判所は、申立人の還付請求を直ちに認容することはせず、CTAに本案について改めて判断するよう命じました。これは、還付請求の要件に関する事実関係の判断が必要であり、最高裁判所は事実認定を行う権限を持たないためです。

FAQs

本件における重要な争点は何でしたか？	VAT還付請求における120日ルールの適用に関する解釈が争点でした。特に、BIR Ruling No. DA-489-03が、このルールの適用にどのような影響を与えるかが問題となりました。
120日ルールとは何ですか？	120日ルールとは、NIRC第112条（D）項に規定されているもので、税務署長が還付または税額控除の決定を行うまでの期間を指します。
BIR Ruling No. DA-489-03とは何ですか？	BIR Ruling No. DA-489-03は、納税者がCTAに司法救済を求めるにあたり、必ずしも120日間の待機期間を経る必要はないと解釈できる内容の裁定です。
最高裁判所は、Aichi事件とSan Roque事件における過去の判例をどのように調和させましたか？	最高裁判所は、2003年12月10日から2010年10月6日までの期間は、納税者は120日間の待機期間を経ずにCTAに司法請求を行うことができたと判断しました。
本件において、申立人はなぜ120日間の待機期間を経る必要がなかったのですか？	申立人は、BIR Ruling No. DA-489-03が有効であった期間に、税務署への行政請求とCTAへの司法請求を行ったためです。
最高裁判所は、申立人の還付請求を直ちに認容しましたか？	いいえ、最高裁判所は、還付請求の要件に関する事実関係の判断が必要であるとして、CTAに本案について改めて判断するよう命じました。
本判決は、VAT還付を求める企業にどのような影響を与えますか？	本判決により、VAT還付を求める企業は、その請求手続きにおいて、BIR Ruling No. DA-489-03が有効であった期間を考慮に入れる必要が生じます。
衡平法上の禁反言とは何ですか？	衡平法上の禁反言とは、ある者が以前にした言動に反する主張をすることが許されないという法原則です。

本判決は、VAT還付請求における120日ルールの適用に関する重要な解釈を示しました。VAT還付を求める企業は、本判決の内容を理解し、適切な請求手続きを行う必要があります。

本判決の特定の状況への適用に関するお問い合わせは、ASG Law（連絡先）または電子メール（frontdesk@asglawpartners.com）までご連絡ください。

免責事項：本分析は情報提供のみを目的としており、法的助言を構成するものではありません。お客様の状況に合わせた具体的な法的指導については、資格のある弁護士にご相談ください。
出典: Mindanao II Geothermal Partnership v. Commissioner of Internal Revenue, G.R. No. 204745, 2014年12月8日