PEZA登録企業はVAT還付を請求できるのか？重要な判断基準

G.R. NO. 149671, July 21, 2006

フィリピン経済特区庁（PEZA）に登録された企業が、付加価値税（VAT）の還付を請求できるかどうかは、選択した税制上の優遇措置によって異なります。今回の最高裁判所の判決は、その判断基準を明確にしました。PEZA登録企業がVAT還付を請求できるケースと、その要件について解説します。

はじめに

VAT還付は、企業にとって重要な資金源となり得ます。特に輸出企業にとっては、VAT還付が経営に大きな影響を与えることがあります。しかし、PEZAに登録された企業の場合、VAT還付の取り扱いは複雑で、誤解も生じやすいのが現状です。本判決は、PEZA登録企業がVAT還付を請求する際の重要な指針となります。

本件は、PEZAに登録された企業が、国内で購入した資本財やサービスに対して支払ったVATの還付を求めたものです。争点は、PEZA登録企業がVAT還付を請求できるかどうか、そして、そのための要件は何かという点でした。

法律の背景

PEZA法（共和国法第7916号）は、PEZAに登録された企業に対して、税制上の優遇措置を提供しています。しかし、その内容は企業が選択する税制上の優遇措置によって異なります。重要な条文は以下の通りです。

PEZA法第23条は、PEZA登録企業に対して、以下の2つの税制上の優遇措置のいずれかを選択する権利を認めています。

• 総収入に対して5％の優遇税率を支払うこと
• 大統領令第226号（1987年総合投資法）に基づく所得税免除（ITH）を享受すること

5％の優遇税率を選択した場合、企業はVATを含むすべての税金が免除されます。一方、ITHを選択した場合、所得税は一定期間免除されますが、VATなどの他の国内税は免除されません。

VATは、物品やサービスの販売、輸入に対して課される税金です。VAT登録事業者は、売上に対して課されるVAT（アウトプットVAT）から、仕入に対して支払ったVAT（インプットVAT）を差し引いて納税します。アウトプットVATがインプットVATよりも少ない場合、その差額は還付されることがあります。

事件の経緯

セキスイ樹脂フィリピン社は、PEZAに登録された企業であり、輸出事業を行っていました。同社は、ITHを選択し、VAT登録事業者として登録されました。1997年1月から6月までの期間に、同社は資本財やサービスの購入に対してVATを支払いましたが、アウトプットVATがなかったため、インプットVATが未利用のまま残りました。そこで同社は、未利用のインプットVATの還付を税務署に請求しました。

税務署は、同社がPEZA登録企業であるため、VAT還付を請求する資格がないと主張しました。これに対して同社は、ITHを選択したためVAT納税義務があり、輸出売上に対してはVATがゼロ税率であるため、インプットVATの還付を請求する権利があると反論しました。

この事件は、以下の順で審理されました。

1. 税務裁判所（CTA）：セキスイ樹脂フィリピン社のVAT還付請求を一部認め、4,377,102.26ペソの還付を命じました。
2. 控訴裁判所（CA）：CTAの判決を支持しました。
3. 最高裁判所：税務署が上訴しましたが、最高裁判所は控訴を棄却し、CAの判決を支持しました。

最高裁判所は、以下の点を重視しました。

• セキスイ樹脂フィリピン社は、ITHを選択したため、VAT納税義務があること。
• 同社の売上はすべて輸出売上であり、VATがゼロ税率であること。
• 同社が支払ったインプットVATは、アウトプットVATと相殺できないため、還付されるべきであること。

最高裁判所は、判決の中で以下の重要な点を指摘しました。

「エコゾーンは地理的にはフィリピン国内にありますが、別個の税関地域とみなされ、法律上は外国の土地とみなされます。エコゾーンの境界外からのサプライヤーによるこの別個の税関地域への販売は、輸出とみなされ、輸出販売として扱われます。これらの販売は、ゼロ税率または税率ゼロパーセントの対象となります。」

「セキスイ樹脂フィリピン社の製品の100％が輸出されているため、同社のすべての取引は輸出販売とみなされ、VATゼロ税率の対象となります。同社には、支払ったインプット税を相殺できるアウトプット税がないことが示されています。国内での資本財およびサービスの購入に対して支払ったインプット税は未利用のままであるため、サプライヤーから以前に請求されたインプットVATの還付を請求できます。4,377,102.26ペソの金額は、還付を正当化する超過インプット税です。」

実務への影響

本判決は、PEZA登録企業がVAT還付を請求する際の重要な先例となります。特に、ITHを選択し、輸出売上が多い企業にとっては、VAT還付が経営に大きな影響を与える可能性があります。企業は、税務上の権利を理解し、適切にVAT還付を請求することが重要です。

重要な教訓

• PEZA登録企業は、選択した税制上の優遇措置に応じて、VAT還付を請求できる場合があります。
• ITHを選択した場合、VAT納税義務があり、輸出売上に対してはVATがゼロ税率となるため、インプットVATの還付を請求できる可能性があります。
• VAT還付を請求するためには、適切な証拠書類を準備し、税務署の要件を満たす必要があります。

よくある質問（FAQ）

Q1: PEZA登録企業は、常にVAT還付を請求できますか？

A1: いいえ、VAT還付を請求できるかどうかは、選択した税制上の優遇措置によって異なります。5％の優遇税率を選択した場合、VATは免除されるため、VAT還付を請求することはできません。ITHを選択した場合のみ、VAT還付を請求できる可能性があります。

Q2: 輸出売上がない場合でも、VAT還付を請求できますか？

A2: いいえ、輸出売上がない場合、アウトプットVATが発生するため、インプットVATを相殺することができます。インプットVATがアウトプットVATよりも少ない場合、VAT還付を請求することはできません。

Q3: VAT還付を請求するための要件は何ですか？

A3: VAT還付を請求するためには、以下の要件を満たす必要があります。

• VAT登録事業者であること
• インプットVATを支払ったこと
• アウトプットVATがないこと、またはインプットVATがアウトプットVATよりも多いこと
• 適切な証拠書類（請求書、領収書など）を準備すること
• 税務署の要件を満たすこと

Q4: VAT還付の請求期限はありますか？

A4: はい、VAT還付の請求期限は、VATの支払日から2年以内です。

Q5: VAT還付の申請が却下された場合、どうすればよいですか？

A5: VAT還付の申請が却下された場合、税務裁判所（CTA）に上訴することができます。

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